cku芯片需要什么?
首先就是测序仪,目前CKU芯片仅支持illumina系列测序平台,包括miseq、nextseq、hiseq和novaseq的测序仪,其他测序平台的用户无需看了,直接忽略。
其次就是测序反应试剂盒,也就是测序文库做上机测序前需要准备的测序耗材,这里面分两种,一种是测单端测序的,另外一种是测双端测序的,目前CKU芯片支持单端50bp和双端75bp测序的测序耗材,也就是下图中的SR50和PE75测序反应试剂盒。
然后是index引物盒,主要用来给需要上机测序的文库添加index标签,以便文库混合上机后能区分不同的文库,目前CKU芯片支持0至96个index的index引物盒(也就是最多支持96个文库一次混合测序),如下图,不同index数的引物盒里的index引物排列的顺序是固定的,用户无需记住它们的index排列顺序,只需在上机测序前记准你放入的index引物盒里的index个数和index引物盒在管架里的位置即可。
最后自然就是做好的待测序文库了,CKU芯片支持的最大的文库总量是400ng,支持的单个文库的最大量是20ng,因此理论上支持一次混合400个文库上机测序,但考虑实际操作时会有一定的损耗和浪费,建议一次混库数量在300个以内。
以上就是CKU芯片支持的所有耗材,是不是感觉少了些测芯片文库的建库试剂盒?没错,CKU芯片最大的优点就是无需任何建库试剂盒,无论是DNA芯片还是RNA芯片,都不需要试剂盒,用最简单的建库方法即可完成库的构建。